2019-04-15 21:34:01
我们可以通过了解两种蛋白质的相互作用来治愈癌症吗

在发表在“生物化学杂志”上的一篇论文中,Özdemir博士研究了两个名为Rho GTPases和IQGAPs的蛋白质家族,这些家族已知在癌症转移中发挥重要作用。这些年来,许多研究人员对这两个“可疑”蛋白家族进行了研究,但它们之间的相互作用以前并未完全被理解。

重要的是要了解转移,癌症从其原发部位到其他器官的扩散是如何发生的,因为预防转移意味着控制癌症。这就是为什么Özdemir博士选择研究这些已知能激活转移的蛋白质的原因。

需要大量的概率计算,这项研究才有可能通过计算模拟技术在非常强大的计算机的帮助下实现。研究人员建立了一个模拟环境,其中许多诸如细胞中的水密度,离子和蛋白质的三维结构等元素都被非常精确地模拟。这使得有可能观察到两种蛋白质之间的相互作用,它们结合的点以及蛋白质中键合的形态变化。

模拟用了六个月。该研究观察了两种蛋白质的结合点和序列,大蛋白质如何发现其匹配,以及两种复杂结构如何结合在一起。并且已经确定形成的复杂结构激活了触发细胞转移的机制。

SılaÖzdemir博士的研究在美国国立卫生研究院(NIH)的另一个研究小组的实验室环境中对癌细胞进行了测试和复制,结果显示完全匹配:实验验证了通过计算机模拟。这一发现的最重要成果将是它对设计针对所述机制的药物的贡献。

继在“生物化学杂志”上发表这一领域最着名的期刊之后,Özdemir博士的研究继续作为2018年最具影响力的论文期刊的一部分出版。

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